根据《中共湖北省委、湖北省人民政府关于十堰市机构改革方案的通知》（鄂文〔2001〕54号）、《中共十堰市委、十堰市人民政府关于十堰市机构改革方案的实施意见》（十发〔2001〕20号）文件精神，十堰市移民开发局为市政府直属县级事业单位，赋予行政管理职能。其机构编制方案确定如下：
一、职能转变
要在建设社会主义市场经济的现代化建设的进程中，以党的"十五"期间移民工作总体思路为指导，根据库区经济社会发展布局和可持续发展战略，进一步探索新形势下贯彻"开发性"移民工作的路子。以"南水北调"中线工程建设为契机，积极做好新建工程移民工作，科学合理地编制移民安置规划，组织实施移民搬迁安置，使移民安置得到明显的成效，确保工程顺利进行。实行项目管理和工程监理制度，实现依法移民，加强移民经费的管理、使用，使移民的合法权益得到保护。
二、主要职能
（一）贯彻执行开发性移民工作方针，因地制宜地引导库区调整产业结构，加强库区基础设施建设，改善移民生产生活环境，发展多种经营生产，提高移民的自身发展能力。
（二）依据国家水库移民法规、政策，搞好南水北调中线工程淹没处理及移民安置工作。
（三）制订和实施丹江口、黄龙滩水库移民遗留问题的处理规划。
（四）加强国家预算内移民资金管理，严格资金使用范围，强化项目管理和工程监理制度，提高移民经费投资效益。
（五）积极争取移民优惠政策和库区维护基金，并使之管理使用科学化。
（六）按照市场经济规律运作，指导局下属企业的改制，实现政企分开。
（七）实施科教兴库战略，培养科技致富的带头人。
（八）指导县（市、区）的移民工作。
（九）完成市委、市政府交办的其他工作。
三、内设机构
根据以上职能，市移民开发局设6个职能科室
（一）办公室
协助局领导处理机关政务工作；负责情况综合，上传下达；负责文档、信访、保密、人事、劳资、后勤服务等工作；办理人大、政协提案和行政复议、应诉工作；负责全局固定资产、基本建设的管理工作；督促检查机关各项制度的执行；负责局机关及下属单位党的建设、精神文明建设和社会治安综合治理的日常工作；负责机关群团工作。
（二）综合计划科
编制全市移民遗留问题处理项目规划、移民经费年度预算、决算；按照因地制宜，效益优先的原则，审查和筛选扶持发展生产项目，并按照《库区建设基金项目管理办法》及《十堰市水库移民遗留问题处理项目管理实施细则》的要求督促项目的落实；负责本级和所属县（市、区）移民局项目计划实施的检查验收工作；配合上级主管部门检查移民工程项目、经费的使用及投资效益情况，按照要求汇总上报；负责局机关工作经费开支的预算、决算、财务集中核算；协助做好机关人员的医保金、住房公积金等工作。
（三）库区一科
承担对丹江口库区移民遗留问题处理的协调、指导、服务和监督工作；严格按照部颁《库区建设基金管理办法》，切实履行相应职责，确保项目按计划实施，维护移民合法权益；指导库区农业结构调整，扶持工程项目的技术指导督办实施，促进农业增效移民增收，逐步提高移民生活质量；开展政策研究，积极争取国家对库区的政策支持和项目扶持。
（四）库区二科
承担对黄龙滩库区移民遗留问题处理的协调、指导、服务和监督工作；严格按照部颁《库区建设基金管理办法》，切实履行相应职责，确保项目按计划实施，维护移民合法权益；做好黄龙滩水库滑坡体移民迁建工作，建设和保护库区生态环境，积极探索生态移民之路；扶持工程项目的技术指导督办实施，做好竹山南关移民遗留问题处理工作，积极争取国家的政策支持，尽早使这部分移民脱险、脱难。
（五）库区三科
编制、修订和实施国家南水北调中线工程我市移民安置规划、方案；配合有关部门，做好南水北调中线工程淹没实物指标的调查，核实工作；做好大规模迁建前的移民安置试点和迁建后的移民安置工作。
（六）离退休干部科
负责机关离退休干部职工的管理与服务。
四、人员编制和领导职数
市移民开发局全额拨款事业编制24名。其中：局长1名，副局长3名；科级领导职数11人（科长6人，副科长5人）。